簡介

SureSelectXT 甲基化靶向序列捕獲平臺（Methyl-Seq) 是安捷倫公司推出的全面的甲基化發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)。該平臺為甲基化基因組區(qū)域研究提供了具有單堿基分辨率，同時(shí)高效可靠的檢測方法。現(xiàn)有目錄化產(chǎn)品包括人、小鼠和大鼠甲基化測序設(shè)計(jì)。該產(chǎn)品相比常見的甲基化檢測平臺具有獨(dú)到的優(yōu)勢：

●通過檢測單獨(dú)的 CpG 可獨(dú)具特色地提供比甲基化芯片更多的信息

● 相比全基因組重亞硫酸鹽測序，可提高通量并降低成本

● 可發(fā)現(xiàn)限制性內(nèi)切酶及免疫沉淀所不能檢測的甲基化區(qū)域

優(yōu)勢

●84 Mb 設(shè)計(jì)覆蓋 370 萬 CpG 位點(diǎn)

● 不依賴于甲基化狀態(tài)的探針

● 高靈敏度，分辨率可達(dá)到單個(gè)堿基

● 提高通量并降低成本

● 與現(xiàn)有甲基化方法相比，可降低偏差 (bias)

捕獲測序數(shù)據(jù)與甲基化芯片的比較分析

表 1 捕獲測序探針設(shè)計(jì)區(qū)域與 850K 芯片理論探針交集

表 2 甲基化捕獲測序與 850K 芯片的全方面比較

圖 1 測序數(shù)據(jù)量與捕獲區(qū)域檢測 CpG 位點(diǎn)飽和曲線

圖 2 測序 10×覆蓋，15G 數(shù)據(jù)量下與 850K 重疊位點(diǎn)統(tǒng)計(jì)

圖 3 測序 10×覆蓋，15G 數(shù)據(jù)量下與 850K 重疊位點(diǎn)的相關(guān)性分析

通過對比，發(fā)現(xiàn)甲基化捕獲測序?qū)τ谔囟ɑ虻母采w位點(diǎn)數(shù)上明顯優(yōu)于甲基化芯片。

圖 4 MTOR、EGRF、TP53 基因在兩種甲基化研究技術(shù)下的甲基化水平分析。

紅色為 850K 數(shù)據(jù)，藍(lán)色為捕獲測序數(shù)據(jù)。

報(bào)告大升級

新增結(jié)果展示

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圖 5 顯著差異的高低甲基化位點(diǎn)在不同功能區(qū)域的富集圖

圖 6 沖擊圖

圖 7 火山圖

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